Clipper Stad Amsterdam is na de Havendagen nog steeds in Rotterdam en ligt in de Rijnhaven naast Fenix I en biedt met haar drie masten een imposante aanblik. De Clipper Stad Amsterdam is een volgetuigde driemaster met stalen romp, die in het jaar 2000 onder Nederlandse vlag in de vaart is genomen.

Het plan voor de bouw van dit klassieke zeilschip ontstond in 1995 tijdens het evenement Sail in Amsterdam naar idee van oprichter van Randstad, Frits Goldschmeding. Ook het Amsterdams gemeentebestuur was enthousiast voor dit plan en in 1997 werd begonnen met de bouw van het schip dat geïnspireerd is op het koopvaardijschip De Amsterdam uit 1854 met dit verschil dat het schip over alle moderne hulpmiddelen en apparatuur beschikt. In 2000 werd het schip gedoopt door Rita Kok, vrouw van de premier Wim Kok.

Het schip werd bekend toen de Stad Amsterdam vertrok in opdracht van de VPRO vanuit Plymouth voor een acht maanden durende reis in het kader van het tweehonderdste geboortejaar van de beroemde bioloog/natuuronderzoeker en geoloog Charles Darwin met aan boord Britse schrijver- en wereldreiziger Redmond O'Hanlon.